超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)在基因測(cè)序中的應(yīng)用
一、超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)在基因測(cè)序中的應(yīng)用
隨著技術(shù)的發(fā)展,遺傳信息及其表達(dá)調(diào)控的研究手段越來越多,高通量測(cè)序技術(shù)是其中最有效的手段之一。目前,利用高通量測(cè)序手段研究生物遺傳信息和基因表達(dá)調(diào)控信息已相當(dāng)普及。然而,測(cè)序前需要先制備適當(dāng)大小DNA片段的樣本文庫。因此,測(cè)序前需要對(duì)基因組DNA進(jìn)行破碎,使其片段長(zhǎng)度滿足測(cè)序要求。RNA-seq對(duì)測(cè)序片段的長(zhǎng)度要求也和DNA高通量測(cè)序的一樣。目前三大主流測(cè)序平臺(tái)的平均測(cè)序讀長(zhǎng)基本在100~400bp范圍內(nèi)。其中Illumina測(cè)序平臺(tái)更是主流中的主流,其測(cè)序片段的讀長(zhǎng)是150bp×2,其雙端測(cè)序需要的樣本DNA片段長(zhǎng)度為300bp左右。片段太長(zhǎng)或太短,都不能經(jīng)濟(jì)有效地實(shí)現(xiàn)高通量測(cè)序過程。如片段太長(zhǎng),會(huì)在固定DNA到固體基質(zhì)上時(shí)的效率低下且影響后續(xù)的測(cè)序效果、降低測(cè)序量。如果片段太短,則會(huì)導(dǎo)致測(cè)序讀長(zhǎng)偏短、增加測(cè)序成本和后續(xù)拼接的工作量。因此,測(cè)序前首先要獲得高質(zhì)量的核酸片段。
二、超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)的使用
超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)進(jìn)行破碎前，需將樣品溶解在溶液中，然后通過探頭對(duì)樣品進(jìn)行超聲破碎
三、超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)的應(yīng)用
儀器被廣泛應(yīng)用于生物學(xué)、微生物學(xué)、物理學(xué)、動(dòng)物學(xué)、農(nóng)學(xué)、制藥、石油等領(lǐng)域的教學(xué)、科研、生產(chǎn)。適合單個(gè)樣品量少，樣本數(shù)多實(shí)驗(yàn)的好幫手，例如細(xì)胞破碎，裂解；抽提蛋白、核酸；修剪DNA/RNA；.納米技術(shù)研究，納米材料的分散；.染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)；樣品均質(zhì)、乳化；加速溶解，加速化學(xué)反應(yīng)等其它樣品處理。
